П. Плетнев писал по поводу этого брака Вяземскому:
"Лакиер вступает во второй брак с богатою гречанкой Варваци из таганрогского круга всех наших откупных крезов: Бенардаки, Вофей, Алфераки и проч".
В приданое получила три каменных дома и на бирже три магазина в Таганроге
Елена Марковна была известна в Таганроге как благородная, доброжелательная, погруженная в благотворительность женщина. Долгие годы она возглавляла попечительский комитет Николаевского приюта, созданного при активном участии ее отца Марка Николаевича Комнено-Варваци
В 1840 году Правительствующий сенат издал указ об учреждении в России положения о детских приютах. Исправляющий должность таганрогского градоначальника барон Отто Романович Франк предложил городскому обществу добровольную подписку на пожертвования в пользу образования детских приютов в Таганроге. Собрали около 1000 рублей, но только 6 декабря 1851 года в деревянном одноэтажном доме купца Сари на Александровской улице был открыт Николаевский детский приют. Большую помощь на его обустройство и многочисленные пожертвования на его содержание оказала Елена Марковна Лакиер.
16 ноября 1886 года по инициативе Марка Николаевича Комнино-Варваци учредили устав Общества «Ясли», непременными членами которого обязаны были быть пожизненно его дети Елена Марковна Лакиер и Александра Марковна Попудова. 8 февраля 1890 года в доме, где первое время находился приют на углу Александровской улицы и Полицейского переулка, состоялось его освящение.
Елена Марковна также состояла в составе попечительного совета о тюрьмах. Когда в 1909 году произошла крупная кража из Греческого монастыря ценной церковной утвари, Елена Марковна пожертвовала большую сумму денег на их восполнение
Скончалась в своем имении на Золотой косе